據臺灣《聯合晚報》報道，臺灣當局領導人的“特赦權”，除半個世紀前的黃百韜之子黃效先觸犯殺人死罪，獲“特赦”減為無期徒刑外，近20年來，包括李登輝與陳水扁2位前臺當局領導人都曾頒發過“特赦令”。其中，最令民眾印象深刻的是“特赦”施明德等美麗島“政治犯”等。
臺灣法律界人士表示，“憲法”及“赦免法”對當局領導人行使“特赦”權并沒有條件限制，想赦誰就可赦誰，但胡亂行使“特赦”，恐招致民意反彈，加上當局領導人的“特赦權”，本質上是以政治力介入司法權，負面影響極大，因此歷任當局領導人都慎審行使“特赦權”。
李登輝在1990年就任時，為促進政治和諧，健全島內政黨政治，頒令“特赦”美麗島涉案者施明德、許信良等9人。該次的“特赦”，另涵蓋復權可參加公職選舉，以及蔡有全等11人，獲得免除其刑的“特赦”。
在阿扁8年間，曾在2000年12月，“特赦”因宗教信仰拒服兵役的黃嘉明等19人，還有工運人士曾茂興及蘇炳坤，另在2007年6月，以“其情可憫”，彰顯當局關懷農民的用心，特赦“白米炸彈客”楊儒門。
