臺灣海基會董事長江丙坤請辭的消息傳出后，島內各界都感到很突然，希望給江丙坤更多的支持。

　　6日，馬英九在接受臺灣媒體采訪時表示，他充分肯定江丙坤的工作，不會批準江丙坤的辭職請求。

　　今天早上我看到報上一些報道以后，我也跟他通了電話，讓他安心。我看報上說，他一定要走，那我就說一定不可以走，我有跟他講說，做這個工作，一定會有很多人不高興，像我的話，每天都有人在罵，如果每天都因為這些事情，覺得很困擾就不想干的話，我想恐怕很多事情都無法推動了。我就說還是要有一些抗壓性，他說他抗壓性是不小，但是家人受到傷害，他實在是不忍，同時他覺得身體沒有以前好，我說看起來你還蠻好的，所以我當場就請他，不要有這個想法，當場把他辭呈退回去。

　　隨后，馬英九辦公室發言人王郁琦對外表示，馬英九指示全力慰留江丙坤。

　　有評論說，江丙坤在擔任海基會董事長期間，常有人以江丙坤兒子在大陸投資，違反利益回避原則為由來打擊他，給他造成很大困擾，這才是他請辭的真正原因。臺灣“陸委會”主委賴幸媛6日表示，過去兩岸兩會協商成果豐碩，江丙坤貢獻良多。外界對他的中傷“相當不公平”，希望他能繼續留任。