臺灣《旺報》29日社評說，《兩岸租稅協議》于延宕5年多后，終于在本月25日完成簽署，臺商將握有向兩岸政府申請行使雙邊“預先訂協議（APA）權利”，同一筆所得被兩岸政府重復課稅及查稅情形將不再發生，而受雇大陸的個人薪資，將只須在大陸繳稅，排除在臺灣繳稅的義務，困擾臺商的兩岸雙重課稅問題將獲得解決。由于大陸放棄部分課稅權，估算臺商每年將可減少稅負39億元（新臺幣，下同），臺灣稅收將凈增超過80億元。

　　租稅協議（《海峽兩岸避免雙重課稅及加強稅務合作協議》）談判延宕多年的主要困難，在如何適應兩岸因政治壁壘而形成的特殊商業行為：一是，租稅協議生效實施后，兩岸稅政機關需要建立稅務信息交換機制，企業稅務信息將相互曝光。長期以來，不少臺商為規避大陸法規而進行“灰色”操作，包括納稅在內。協議簽署后，其合法性如何界定？二是，在兩岸尚未開放投資年代，大多數臺商藉由第三地注冊公司轉投資方式迂回登陸，在陸臺商約有8成如此，這類商企能否享有租稅協議優惠？

　　協議采從新從寬原則，對臺商臺企稅務問題劃定“四不”原則：不溯及既往、不將信息作刑事案件使用、不作稅務外用途、不是具體個案不提供；協議并允許透過第三地投資控股臺商，只要實際管理、主體運作在臺灣，均可適用租稅協議。大陸并放棄股權交易課稅權，亦即資本利得課稅權歸屬臺灣。

　　租稅協議生效后，臺商的經營環境可能因而改變，兩岸官方為適應協議生效，可能必須修正部分稅務規章，改變稅收的技術性操作方式，部分企業可能出現經營方式斷裂，但這不會是普遍現象，臺商應完整了解租稅協議文本，主動因應變化。如資本利得課稅權歸臺灣后，第三地臺商可及早進行股權結構調整，在第三地注冊、此前以F股身分在臺灣上市融資的臺商臺企，需放棄外資身分或放棄賦稅優惠，兩利只能取其一。

　　租稅協議生效后，臺灣稅收增加僅是眼前小利，協議結構性利多更重要。首先協議把外資在臺設立的企業一并納入適用，將具有鼓勵外資在臺投資之誘因，繼續以臺灣作為進入大陸市場跳板。第二，大陸自主供應鏈崛起后，臺干和臺商在大陸的工作和經營環境逐漸惡化，兩岸關系又充滿不確定性，租稅協議的簽署將釋放大陸對臺商、臺干及個人投資者的制度性枷鎖，有利于兩岸合作交流關系在不確定的政治因素干擾下不至于中斷。

　　第三，租稅協議顯示出兩岸政策的靈活性。經濟體的宏觀調控，大多通過兩種手段來實現，一是貨幣政策，二是財稅政策，租稅協議以稅收手段引導兩岸投資走向及企業經營方式，完成資源的有效配置。在政局復雜的當下，將兩岸經濟利益最大化，實屬不易。同時，協議的簽訂更增強了兩岸財稅政策的規范及透明度，亦是大陸近年來提倡“依法治國”及投資貿易便利化的題中之義。

　　臺商投資大陸的家數、金額及投入人員均遠高于陸商投資臺灣，此項協議簽定，臺灣所受到的好處，將遠比大陸多。臺灣過去最擔心的稅務數據交換問題，因我方握有控制權，且協議明文規定不溯既往、不作為刑事用途，對臺商的相關信息將得以有效保護。

　　《兩岸租稅協議》歷經5年多的談判協商均因嚴重歧見而無法達成，此次在《兩岸服貿易協議》未能生效實施前得以優先成局，顯示兩岸均能理解與諒解對方的困難并愿意予以適當尊重，對于穩定兩岸經貿正�；�的后續協商推進，具有很大的鼓勵意義。

　　相比服貿、貨貿兩個協議等事關兩岸重大戰略經濟利益來說，租稅協議只是兩岸互利漸進的一小步。若服貿與貨貿擱置，意味著ECFA不能獲實質性的兌現，兩岸就談不上真正互利，在風云變幻的區域經濟中，臺灣會與全球最具活力的經濟體漸行漸遠。

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